Core Lab: Genomics
¿Qué es el Core Lab de Genomics?
El Core Lab Genomics - Bio Accelerated Sequencing Environment - es el Laboratorio del Tecnológico de Monterrey donde se realiza Secuenciación Genómica Masiva de Ultima Generación (NGS, por sus siglas en ingles).
Nuestra VISIÓN es contribuir en fortalecer la investigación, la generación y transferencia de conocimiento en México, a través de la generación y el análisis de datos genómicos aplicados de manera transversal en áreas como: medicina clínica, medicina genómica, agroindustria, alimentación, diagnóstico de enfermedades, estudio de muestras medioambientales, epidemiología genómica, entre otras.
Servicios que ofrece
Para cotizar los servicios de análisis bioinformático, favor de referirse al correo tecbase@servicios.tec.mx
Para conocer los Servicios Especializados de Investigación que el Core Lab ofrece, te invitamos a ingresar a la página de Market Tec.
¿Porqué trabajar con nosotros?
Es el único laboratorio a Nivel Nacional que cuenta con todos los equipos de tecnología Illumina, desde el más pequeño (Iseq) hasta el más grande (Novaseq), lo que nos permite atender una gran diversidad de muestras para secuenciar, desde genomas pequeños de microorganismos hasta grandes cantidades de genomas de organismos complejos. Tenemos montados diversos servicios como: Secuenciación de Genoma Completo (WGS), Exoma, RNA-Seq, Secuenciacion de Célula única (Single Cell), metagenómica Shotgun, Metagenomica 16s, Secuenciación de fragmentos específicos, DNA ambiental.
Por otro lado, otro gran valor agregado es que el modelo de operación permite brindar servicio externo a Investigadores externos al Tecnológico de Monterrey, además los acuerdos comerciales con Illumina nos permite dar precios competitivos en América Latina y el tiempo de entrega de resultados es un tiempo muy competitivo a nivel internacional. Contamos también con especialistas altamente capacitados y continuamente entrenados que, junto con el equipamiento periférico automatizado de generación de librerías, nos permite ejecutar proyectos de una forma muy robusta, eficiente y confiable.
Finalmente, el expertis del recurso humano del Core Lab Genomics nos permite atender, de una forma muy personalizada proyectos de diversas áreas: alimentos, medicina, industria agrícola, Diagnóstico, etc.
¿Con quiénes trabajamos?
• IMSS-Siglo XXI – México. Actualmente trabajamos en un proyecto relacionado a muestras clínicas de recurrencia de cáncer.
• Universidad de Azuay – Ecuador. Estamos trabajando con varios proyectos relacionados a uso de probióticos de alimentos fermentados.
• INMEGEN – México. Secuenciación de Exoma humano.
• Instituto de Ciencias del Mar y Limnología UNAM – México. Genómica poblacional.
• Universidad del Mar - UMAR, Campus Puerto Ángel. DNA ambiental.
• Instituto Nacional de Cancerología - INCan. Metagenomica shotgun y exomas.
• Museo del desierto - MUDE. Genómica de la conservación y transcriptimica para la caracterización de moléculas bioactivas.
• Proyecto oriGen - Secuenciación de genoma completo.
• Solena - Asesoramiento y consultoría en metagenómica agrícola.
• Escuela Nacional de Estudios Superiores de Morelia - Genómica poblacional de mangle.
Equipamiento y tecnología
El iSeq 100, es un Sistema ideal para la Secuenciación de genomas pequeños (bacterias, virus, plásmidos etcétera. Es ideal para realizar estudios de metagenómica de 16s.
Este equipo está enfocado a realizar estudios de metagenómica más profundos, realizar Secuenciación de genes blanco, nos permite obtener arriba de A 15 Gb de información con 25millones de lecturas and longitudes de lectura de 2 × 300 bp.
Es el equipo más grande para la realización de secuenciación en longitudes cortas que existe en el mercado, se utiliza cuando los proyectos requieren secuenciación masiva de muestras, o para alcanzar mayor profundidad de secuenciación, por ende, secuencias más robustas.
Responsable y datos de contacto
Dra. Rocío Alejandra Chávez Santoscoy
Profesora-Investigadora y Líder del Core Lab Genómics
chavez.santoscoy@tec.mx y tecbase@servicios.tec.mx
Centro de Biotecnología- FEMSA 1er. piso